Module « Analyse de données issues du séquençage haut débit»
Volume horaire
- 14 heures de cours magistral.
Description du module
- Présentation des différentes méthodes de SHD.
- Transformée de Burrows-Wheeler.
- FM-Index
- Arbres à ondelettes
- Présentation des méthodes d'alignement de fragments (BOWTIE, BWA).
- Présentation de la problématique et des stratégies d'assemblage de Novo (graphe de chevauchement et graphe de Bruijn)